痛经以温通经脉，行气化瘀为治之要法。《诸病源侯论》云：“妇人月水来腹痛者，由劳伤气血，以治体虚，受风冷之气客于胞脉，损伤冲任之脉。”指出风冷凝滞经脉而致痛经。又如宋代《妇科秘书·经侯不调门》云：“经水将来作痛者，血瘀气滞也，腹中阵阵作痛，乍作乍止，气血俱虚，治当行经顺气。”“经水行后作痛者，气血虚也，治当调养气血。”指出经前、经期、经后痛经，或因实，或因虚。孙师认为痛经之病因虽多，证侯表现多样，其发病机制概以“不通则痛”述之，治疗目的则使其“通而不痛” ，临床上常见血滞血瘀，寒邪凝滞，湿热下注，气血虚弱，肝肾虚损等所致之痛经，有实有虚。妇女本不足于血，即使实证痛经，亦常兼不足，均表现在经血不畅之共性，因而临床上痛经多虚实夹杂，以虚为多，治当温通血脉，行滞止痛。旨在鼓动脉气，经血畅行，血脉流通，则痛自止。孙师常用《金匮要略》之温经汤，或以四物汤加味治之，偏气滞加桔核、山楂核、青陈皮、郁金、乌药、金铃子、元胡等，偏血瘀加丹参、徐长卿、莪术、乳香、没药、失笑散等，偏于寒，加小茴香、淡附、吴萸、姜黄等。

此外，配合外治，以求达到捷效，用自制之“痛经药物热敷袋” 敷于小腹，取药性辛散香窜，温经散寒，活血行滞效用，以期直达病所，与内服共奏温经通脉，行滞止痛之良效。